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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
14/02/2017 |
Data da última atualização: |
30/01/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
WOHLRES-VIANA, S.; ARASHIRO, E. K. N.; REIS, D. R. de L.; FERNANDES, L. E.; PEIXOTO, M. G. C. D.; MACHADO, M. A.; VIANA, J. H. M. |
Afiliação: |
S. Wohlres-Viana, UFJF; E. K. N. Arashiro, UFJF; DANIELE RIBEIRO DE LIMA REIS FAZA, CNPGL; L. E. Fernandes; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO HENRIQUE MOREIRA VIANA, Cenargen. |
Título: |
Polymorphisms and alternative splicing of the luteinizing hormone receptor of dairy cattle. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 2, 2016. |
Páginas: |
12 p. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract The aim of this study was to screen for variability in the luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor (LHCGR) and to determine the occurrence of LHCGR mRNA isoforms in two dairy breeds of cattle. Granulosa cells from dominant ovarian follicles were recovered from 16 Gir and 16 Holstein cows, and total RNA was extracted. Complementary DNA was synthesized and PCR was used to generate amplicons for sequencing. Chromatograms were evaluated, and multiple sequences were aligned and analyzed for the presence of polymorphisms, allele frequency, polymorphic information content (PIC), and Hardy-Weinberg equilibrium (HWE). Twentyone single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified in LH receptor mRNA. Seventeen SNPs were identified in Gir cattle (seven exclusively), and 14 were found in Holstein cattle (four exclusively). Seven of the 21 polymorphisms found did not alter which amino acid was translated. Eight SNPs caused a change to an amino acid in a different chemical group. Classification of SNPs according to PIC values identified 12 as being highly informative in Gir cattle and five in Holstein. Eight SNPs deviated from HWE in Gir compared with 11 in Holstein, and eight in both breeds. Two isoforms were also identified, one in exon 1, which lacks 30 nucleotides beginning at position 118, and the other in exon 10. Taken together, these data show that LHCGR in dairy cattle breeds has a high frequency of polymorphism and exists in multiple isoforms resulting from alternative splicing. MenosAbstract The aim of this study was to screen for variability in the luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor (LHCGR) and to determine the occurrence of LHCGR mRNA isoforms in two dairy breeds of cattle. Granulosa cells from dominant ovarian follicles were recovered from 16 Gir and 16 Holstein cows, and total RNA was extracted. Complementary DNA was synthesized and PCR was used to generate amplicons for sequencing. Chromatograms were evaluated, and multiple sequences were aligned and analyzed for the presence of polymorphisms, allele frequency, polymorphic information content (PIC), and Hardy-Weinberg equilibrium (HWE). Twentyone single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified in LH receptor mRNA. Seventeen SNPs were identified in Gir cattle (seven exclusively), and 14 were found in Holstein cattle (four exclusively). Seven of the 21 polymorphisms found did not alter which amino acid was translated. Eight SNPs caused a change to an amino acid in a different chemical group. Classification of SNPs according to PIC values identified 12 as being highly informative in Gir cattle and five in Holstein. Eight SNPs deviated from HWE in Gir compared with 11 in Holstein, and eight in both breeds. Two isoforms were also identified, one in exon 1, which lacks 30 nucleotides beginning at position 118, and the other in exon 10. Taken together, these data show that LHCGR in dairy cattle breeds has a high frequency of polymorphism and exists in multiple isoforms resulting from a... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
LHCGR isoforms. |
Thesaurus Nal: |
reproduction; zebu. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155636/1/Cnpgl-2016-GMR-Polylmorphisms.pdf
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Marc: |
LEADER 02217naa a2200241 a 4500 001 2064058 005 2023-01-30 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aWOHLRES-VIANA, S. 245 $aPolymorphisms and alternative splicing of the luteinizing hormone receptor of dairy cattle.$h[electronic resource] 260 $c2016 300 $a12 p. 520 $aAbstract The aim of this study was to screen for variability in the luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor (LHCGR) and to determine the occurrence of LHCGR mRNA isoforms in two dairy breeds of cattle. Granulosa cells from dominant ovarian follicles were recovered from 16 Gir and 16 Holstein cows, and total RNA was extracted. Complementary DNA was synthesized and PCR was used to generate amplicons for sequencing. Chromatograms were evaluated, and multiple sequences were aligned and analyzed for the presence of polymorphisms, allele frequency, polymorphic information content (PIC), and Hardy-Weinberg equilibrium (HWE). Twentyone single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified in LH receptor mRNA. Seventeen SNPs were identified in Gir cattle (seven exclusively), and 14 were found in Holstein cattle (four exclusively). Seven of the 21 polymorphisms found did not alter which amino acid was translated. Eight SNPs caused a change to an amino acid in a different chemical group. Classification of SNPs according to PIC values identified 12 as being highly informative in Gir cattle and five in Holstein. Eight SNPs deviated from HWE in Gir compared with 11 in Holstein, and eight in both breeds. Two isoforms were also identified, one in exon 1, which lacks 30 nucleotides beginning at position 118, and the other in exon 10. Taken together, these data show that LHCGR in dairy cattle breeds has a high frequency of polymorphism and exists in multiple isoforms resulting from alternative splicing. 650 $areproduction 650 $azebu 653 $aLHCGR isoforms 700 1 $aARASHIRO, E. K. N. 700 1 $aREIS, D. R. de L. 700 1 $aFERNANDES, L. E. 700 1 $aPEIXOTO, M. G. C. D. 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aVIANA, J. H. M. 773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 15, n. 2, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Registros recuperados : 109 | |
2. | | OLIVEIRA, F. R. de; REIS, D. R. de L.; SOUZA SOBRINHO, F. de; AZEVEDO, A. L. S. Transferência de marcadores microssatélites entre espécies do gênero Brachiaria. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 16., 2015, Juiz de Fora, MG Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015. 1 CD-ROM. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 185.). 1 p.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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3. | | BRION, C. T.; SANTOS, L. B.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A. Banco de DNA de Bovinos: avaliação de metodologias alternativas para extração de DNA. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 16., 2015, Juiz de Fora, MG Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015. 1 CD-ROM. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 185.). 2 p.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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4. | | MAGALHÃES, R. L. O. de; NOGUEIRA, A. L.; DOMINGUES, R.; REIS, D. R. de L.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; AZEVEDO, A. L. S. Validação de um painel específico (Fingerprinting) para identificação da cultivar BRS Integra. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 27., 2023, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2024. p. 127-131. (Embrapa Gado de Leite. Eventos Técnicos & Científicos, 2). Pibic/CNPq.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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6. | | LANGE, C. C.; BRITO, M. A. V. P. e; SILVA, F. S. DA; ALVIM, M. C. T.; REIS, D. R. de L.; DOMINGUES, R. Identificação de estafilococos coagulase negativos isolados mastite bovina por sequenciamento do rDNA 16S. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 26., 2011, Foz do Iguaçú. Resumos... Foz do Iguaçú: SBM, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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7. | | WOHLRES-VIANA, S.; BERNARDO, K. B.; CUNHA, A. C. L. M.; REIS, D. R. de L.; ARASHIRO, E. K. N.; MACHADO, M. A.; VIANA, J. H. M. Identification of SNPs in the luteinizing hormone receptor transcript of Gyr (Bos indicus) granulosa cells. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: Sociedade Brasileira de Genética, 2012.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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8. | | LANGE, C. C.; BRITO, M. A. V. P. e; SILVA, F. S.; ALVIM, M. C. T.; REIS, D. R. de L.; DOMINGUES, R. Identification of coagulase negative staphylococci isolated from bovine mastitis by 16S rDNA sequencing. In: Simpósio Embrapa LabEx EUA de Sanidade Animal, 2., 2012, Brasília. Proceedings... Brasília: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012 p. 13Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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9. | | GOMIDE, M.; LEMOS, F.; REIS, D. R. de L.; JOSÉ, G.; LOPES, M.; MACHADO, M. A.; ALVES, T.; COELHO, C. M. Identification of dysregulated microRNA expression and their potential role in the antiproliferative effect of the essential oils from four different Lippia species against the CT26.WT colon tumor cell line. Revista Brasileira de Farmacognosia, v. 26, n. 5, p. 627-633, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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10. | | SABINO, Y. N. V.; RIBEIRO, J. B.; REIS, D. R. de L.; FOCHAT, R. C.; CARNEIRO, J. da C.; RIBEIRO, M. T.; MACHADO, M. A.; PAIVA, A. D. Identification and gene prospection of bacteriocinogenic bacteria isolated from rumen In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28., 2015, Florianópolis. Resumos. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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11. | | HOSKEN, B.; BRITO, M. A. V. P. e; REIS, D. R. de L.; SOUZA, G. N. de; ALMEIDA, P.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. R.; RIBEIRO, J. B. Investigação da resistência à eritromicina em linhagens de Streptococcus agalactiae isoladas de casos de mastite bovina. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE QUALIDADE DO LEITE, 7., 2017, Curitiba. Anais... Curitiba: Conselho Brasileiro de Qualidade do Leite, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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12. | | WOHLRES-VIANA, S.; ARASHIRO, E. K. N.; REIS, D. R. de L.; FERNANDES, L. E.; PEIXOTO, M. G. C. D.; MACHADO, M. A.; VIANA, J. H. M. Polymorphisms and alternative splicing of the luteinizing hormone receptor of dairy cattle. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 2, 2016. 12 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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13. | | SANTOS, F. F.; GUIMARAES, A. S.; RIBEIRO, J. B.; MENDONCA, L. C.; LANGE, C. C.; SILVA, M. A. S.; REIS, D. R. de L.; MACHADO, M. A. Presence of mecA in Staphylococcus spp. isolated from bovine intramammary infections. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: Sociedade Brasileira de Genética, 2012.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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14. | | SEIBERLICK, O. S. G.; CARVALHO, B. O.; NASCIMENTO, J. C.; AZEVEDO, A. L. S.; REIS, D. R. de L.; LEDO, F. J. da S.; MACHADO, M. A. Varredura do banco ativo de germoplasma de capim-elefante para identificação de regiões genômicas associadas a apomixia. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 24., 2019, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2019. 4 p. Editor Técnico: Leônidas Paixão Passos, Embrapa Gado de Leite.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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15. | | SABINO, Y. N. V.; FOCHAT, R. C.; REIS, D. R. de L.; RIBEIRO, M. T.; LIMA, J. C. F.; CARNEIRO, J. da C.; RIBEIRO, J. B.; PAIVA, A. D. Bactérias bacteriocinogênicas isoladas de líquido ruminal: identificação, presença de genes e caracterização parcial dos peptídeos. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DO LEITE, 13., 2015, Porto Alegre. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2015. 4 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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16. | | CARVALHO, B. de O.; PEREIRA, H. P.; SEIBERLICK, O. S. G.; REIS, D. R. de L.; CARVALHO, W. A.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F. Análise de genes diferencialmente expressos em resposta à infecção por Streptococcus agalactiae. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 24., 2019, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2019. Editor Técnico: Leônidas Paixão Passos, Embrapa Gado de Leite.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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17. | | HOSKEN, B. de O.; ALMEIDA, P. A. A.; BRITO, M. A. V. P. e; REIS, D. R. de L.; MENDONCA, L. C.; SOUZA, G. N. de; MACHADO, M. A.; RIBEIRO, J. B.; SILVA, M. R. Caracterização fenotípica e genotípica da resistência à eritromicina em linhagens de Streptococcus agalactiae isoladas de amostras de leite bovino em Minas Gerais. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE LEITE, 20. 2017, 4 p. Anais... Juiz de Fora/MG. Embrapa Gado de Leite.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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18. | | MACHADO, M. A.; AZEVEDO, A. L. S.; GASPARINI, C.; BERNARDO, K. B.; REIS, D. R. de L.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SILVA, M. V. G. B.; REGITANO, L. C. de A.; VERNEQUE, R. da S. Fine mapping of tick resistance QTL on BTA23 in gyr x holstein population. In: Conference International Plant & Animal Genomes, 19., 2011, San Diego.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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19. | | SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; PANETTO, J. C. do C.; PAIVA, L. DE C.; GONÇALVES, G. S.; MACHADO, M. A.; REIS, D. R. de L.; ALVES, B. R. C. (ed.). Girolando breed genetic improvement program - Sire summary - Progeny test results - June 2018. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2018. 62 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 222)Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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20. | | REIS, D. R. de L.; PEREIRA, H. P.; EGITO, A. A. do; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; KIM, E. S.; SONSTEGARD, T. S.; MARTINS, M. F.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A. Development of tetra-primer ARMS-PCR protocol to genotype the prolactin receptor SNP 39136666 and assessment of this SNP in Brazilian locally adapted cattle breeds. Arquivo Brasileiro e Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 73, p. 534-538, 2021. Communication.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
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